Der Große Alpsee ist ein 3,27 km langer und bis zu 1 km breiter See mit einem Umfang von 8,1 km im Landkreis Oberallgäu, Schwaben, Bayern westlich von Immenstadt im Allgäu.
Er erstreckt sich in Ost-Westrichtung und wird gespeist von der Konstanzer Ach (von Westen kommend), von zehn Seitenbächen aus den nördlich liegenden und vier Seitenbächen aus den südlich liegenden Bergen. Weniger als 200 Meter westlich schließt sich als Rest einer verlandeten Bucht der 4,6 ha große Teufelssee an. Der Große Alpsee entwässert über den Kleinen Alpsee, der sich am östlichen Ausfluss des Sees befindet und eine Fläche von 7,5ha aufweist, in die Iller.
Bedingt durch seine Lage in einem Tal, das sich ebenfalls in Ost-Westrichtung erstreckt, stellt er bei den vorherrschenden westlichen Winden meist ein gutes Segel- und Surfrevier dar. Winde aus anderen Richtungen führen jedoch vor allem im östlichen Teil des großen Alpsees häufig zu starken Verwirbelungen. Deshalb kann sich die Windrichtung oft sehr schnell ändern.
Angesichts der Erdkrümmung hat der Große Alpsee über seine größte Länge hinweg (Ost-West-Ausdehnung) eine Aufwölbung der Oberfläche von rund 21 cm.
Der See ist Eigentum des Freistaates Bayern, für dessen Verwaltung die Bayerische Verwaltung der staatlichen Schlösser, Gärten und Seen zuständig ist.
Das Landschaftsschutzgebiet Großer Alpsee umfasst ca. 827ha und grenzt an das sich westlich anschließende Landschaftsschutzgebiet Kleiner Alpsee bei Immenstadt mit einer Größe von 67ha an.